Con cuatro estaciones tan diferentes como definidas, Japón se caracteriza por ser un país lluvioso y con una alta humedad. Mientras en el norte el clima varía de ligeramente frío a templado, con intensos veranos y grandes nevadas en invierno, el centro del país es cálido, con veranos húmedos y inviernos breves y suaves. En el sur, en tanto, los veranos son extensos, muy cálidos y húmedos, y los inviernes, cortos y suaves. En algunos casos, el clima se ve afectado por los centros ciclónicos y anticiclónicos.

Tokio, por su parte, se distingue por poseer un clima templado, con una humedad cerca al 63%. Un 45% de los días del año es lluvioso, otro 40% nublado, un 10% despejado y en el restante 5%, nieva. En invierno, la temperatura promedio es de 4° C, con algunas nevadas, y en verano es de 24° C. Respecto de las lluvias, la precipitación anual llega a los 152 centímetros. En 2003 se registró una marca histórica, al caer 171 milímetros.