Empezó a jugar al tenis a la edad de nueve años. Su padre, Rudolf, es un hombre de negocios y el alcalde de su ciudad natal, Deutsch-Wagram, su madre, Michaela es dependienta. Tiene un hermano más pequeño, Gerald. Jurgen habla alemán, ingles y francés. Sus ídolos de infancia eran Stefan Edberg, Michael Stich y Patrick Rafter. Consiguió el título junior en Wimbledon en 1999. Entre sus aficiones está ver partidos de sus equipos de fútbol preferidos, el Bayern Munich y el Austria Viena, jugar al golf y ver películas. Su preparador físico es Manfred Kogler y su entrenador, desde 1996, Karl-Heinz Wetter.